第三代单分子实时测序服务(PacBio RS II)

 

 

概述

 

    上海人类基因组研究中心---翰宇的战略合作伙伴,2013年率先引进了华东地区首台第三代测序仪PacBio RS II 。

 

    PacBio RS II测序系统,是基于单分子实时(Single Molecule Real Time, SMRT)DNA测序技术和纳米微孔应用的第三代测序平台。能带来行业最高的一致准确性和最长的读长。它让科学家能够快速经济地完成基因组组装、揭示并了解表观基因组,以及鉴定基因组变异,是基因组从头测序的最佳选择。

 


技术特点

 

        ■ 超长的读长:平均测序读长能达到7,000-8,000bp,最长读长能达到3,0000bp;

        ■ 准确率高:对基因组组装和基因组变异检测,可以最多达到99.999%的准确率;

        ■ 敏感性强:可以检测频率在0.1%的minor variants;

        ■ 无PCR扩增偏好性:样本不需要进行PCR扩增,避免了覆盖度不均一和PCR
             artifacts;

        ■ 最小的GC偏好性(GC bias):在极端高GC和极端低GC区域,可以轻松测定,
             从而保证序列的均匀覆盖度。

 

 

 

技术应用

 

        ■  基因组组装

        ■  全长cDNA测序

        ■  碱基修饰检测