小RNA测序

概述

    小 RNA序列高度保守，可以调控基因的表，长度在18-30nt，主要包括miRNA、snRNA、snoRNA等。小RNA测序技术采用胶分离技术，收集样品中15-35nt的RNA片段，利用高通量测序技术，一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息，依托强大的生物信息分析平台，鉴定已知小RNA，从而解析miRNA、snRNA、snoRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列。

■ 对总RNA(或小RNA)样品进行检测，检测合格后进行小RNA样品制备，经过TA克隆检测合格之后上机测序

■ 进行基本数据处理，包括：原始数据读取，去接头、去污染序列，长度分布统计，基因组比对等

■ 高级生物信息分析内容，包括:小RNA的分类注释，miRNA/snRNA/snoRNA的鉴定，新miRNA预测，差异表达miRNA聚类分析等

■ 高通量：一次测序得到800万条以上的序列

■ 不依赖已知信息：既能鉴定已知小RNA又能发现新小RNA

■ 高分辨率：可以检测单碱基差异

■ 高精确度：从几个到数万个拷贝精确计数